Theo nội dung truy tố xác định, khoảng 07 giờ ngày 05/4/2018, Nguyễn Thanh Tùng đang ở nhà tại số 25, tổ 36, khu vực 5 phường Hưng Phú, quận Cái Răng, thành phố Cần Thơ thì có người nam thanh niên tên Duy (Đức) gọi điện thoại di động hỏi mua ma túy với số tiền 100.000 đồng và hẹn giao ma túy tại nhà trọ Trần Đức thuộc địa bàn phường An Khánh, quận Ninh Kiều, thành phố Cần Thơ thì Tùng đồng ý và điều khiển xe mô tô biển số 71S9 - 6774 đi giao. Đến nút giao thông IC3, khu vực 1, phường Hưng Thạnh, quận Cái Răng, thì bị lực lượng Cảnh sát điều tra tội phạm về ma túy - Công an quận Cái Răng kết hợp với Công an phường Hưng Thạnh, quận Cái Răng kiểm tra, bắt quả tang, thu giữ 03 (gói) giấy bạc bên trong có chứa 10 đoạn ống nhựa hàn kín hai đầu bên trong có chứa chất bột màu trắng. Ngoài ra, khi lực lượng chức năng khám xét nơi ở của Tùng thu giữ nhiều đồ vật có liên quan đến việc mua bán ma túy. Qua kết quả giám định, số chất bột màu trắng thu giữ của Tùng là ma túy, có trọng lượng 0,3282 gam, loại Heroine.
Quá trình điều tra chứng minh được Nguyễn Thanh Tùng bắt đầu mua bán ma túy từ tháng 02/2018. Tùng mua ma túy ở tỉnh Vĩnh Long về chia thành nhiều tép nhỏ để sử dụng và bán lại nhiều lần cho các đối Phan Minh Luân, Nguyễn Hữu Duy, Huỳnh Thế Nhân và nhiều người khác. Ngoài ra, vào năm 2000, Tùng đã bị kết án về tội Mua bán trái phép chất ma túy, đã chấp hành xong án phạt tù nhưng chưa thi hành hình phạt bổ sung và chưa nộp án phí.
Căn cứ vào các tình tiết, chứng cứ có trong hồ sơ vụ án, Viện kiểm sát nhân dân quận Cái Răng đã truy tố bị can Nguyễn Thanh Tùng về tội Mua bán trái phép chất ma túy với các tình tiết định khung: Phạm tội 02 lần trở lên; Đối với 02 người trở lên và Tái phạm nguy hiểm được quy định tại điểm b, c, q khoản 2 Điều 251 Bộ luật Hình sự.